Desa Long Payau, Kecamatan Kayan Hulu, Kabupaten Malinau merupakan daerah dataran tinggi dengan ketinggian 610 ± meter di atas permukaan laut (mdpl), sehingga memiliki kondisi udara yang relatif sejuk, curah hujan relative tinggi dan suhu udara rata-rata mencapai  15-27° C dengan batas wilayah administratif sebagai berikut:

-          Sebelah Utara berbatasan dengan Malaysia Bagian Serawak 

-          Sebelah Timur berbatasan dengan Desa Long Ampung

-          Sebelah Selatan berbatasan dengan Desa Long Nawang

-          Sebelah Barat berbatasan dengan Desa Metun

Dari segi administrasi pemerintahan, wilayah Desa Long Payau terbagi menjadi 1 (satu) Rukun Tetangga (RT) yang menjadi satuan wilayah terkecil dalam penyelenggaraan pemerintahan desa dan pelayanan kepada masyarakat. Kondisi geografis yang berada di kawasan perbukitan dan perbatasan negara memberikan karakteristik tersendiri terhadap kehidupan sosial, ekonomi, dan budaya masyarakat Desa Long Payau.